如果企业是信息软件开发类企业，那当然是申请软件著作权了，如果企业为制造类企业，那当然申请专利更好。

不同点

1、软著和专利的申请时长不同

从软著改革之后，软著需要一个半月到三个月可以拿到证书。

而专利由于包含的类目多（发明、实用新型、外观设计），审查周期长，实用新型的下证周期在6-10个月不等，特别是发明专利，往往需要2-3年才能下证，再加上目前国家知识产权局对非正常专利申请的管控，授权率也下降了很多。

2、软著和专利的保护范围不同

专利不同于软著那种浮于表面的表达形式，专利保护的是解决问题的思想。

比如一个离线传送文件系统，如果申请专利，那保护的是如何实现离线传送文件。

独权基本如下：

设置一个文件服务器；当选择离线传送时，文件发送者将文件上传到文件服务器；当文件接收者上线时，文件服务器弹出文件传送的消息。

那任何采用这种方法离线传送文件的系统都在专利的保护范围之内，无关于程序代码。

那如果是申请软著呢？软著保护的是实现离线传送的程序代码。

基于相同的软件思想，但实现离线传送文件系统的程序代码有千千万万种，每种代码都可以享有各自的软件著作权。

但是这个思想方法，基本只能申请一项专利。

3、收费标准和方式不同

软著是只有前期的申请费用，之后再无其他费用。

而专利除了初期相对高额的办理费用外，每年还要缴纳年费，不缴纳的就会视为主动放弃专利所有权。