一：用途不完全相同：

APP软著电子版权认证证书仅限以下用途：

1）各大应用商店APP上架：用于华为、腾讯、小米、OPPO、VIVO、阿里、360、百度等APP应用市场上架版权归属证明，上架审核时直接电子化查验，展示查验结果。

2）小程序备案：微信小程序应用平台、百度小程序应用平台、酷狗小程序应用平台、快手小程序应用平台，抖音小程序应用平台。

3）广告营销投放：腾讯优量汇广告平台、快手联盟广告投放平台、抖音巨量引擎广告投放平台。

软件著作权登记证书用途包括以下方面：

软件著作权登记证书只要是需要计算机软件版权归属证明的地方均可使用。

1）包含了APP软著电子版权认证证书用途，也可以用于APP上架、小程序备案等；

2）企业知识产权证书，科技项目申报证明材料；

3）版权权属证明，软件著作权侵权司法证明材料；

4）高新技术企业认定知识产权、科技成果证明材料；

5）软件产品评估、软件企业评估必备条件；

6）软件产品增值税即征即退必备条件；

7）企业无形资产证明材料；

8）个人职称评定、项目结项评审等证明材料。

二：办理周期不同

1）APP软著电子版权认证的办理有以下周期：10-15工作日、3工作日、2工作日、1工作日。最快可当天下证。当然办理周期越短费用越高，费用几百到几千不等。

2）软件著作权登记目前主要分为普通登记和加急登记：2023年6月无纸化新政后普通登记的办理周期约3-4个月左右，加急登记的办理周期目前是自受理日起60日内。代理费用在千元左右。